Assim como o hatch Astra, a Zafira chega em sua linha 2009 com poucas mudanças, sendo a principal a adoção do novo motor 2.0 FlexPower, estreado pelo Vectra Next Edition e depois colocado no Vectra GT Remix.
Como os outros modelos que compartilham esse motor, a Zafira agora atende às novas normas de emissões, e conta com 133/140 cv e 18,9/19,7 kgfm de torque, a 5600 e 2600 rpm, respectivamente (gasolina/álcool).
Além disso, a Zafira 2009 ganhou novos mostradores do quadro de instrumentos, com design mais moderno e que proporciona leitura mais fácil. Suas versões continuam as mesmas, Comfort, que começa em 61.951 reais, Expression, Elegance e Elite, esta começando em 74.382.